Omeka 2.5.1をインストールしてみます。すでにmysql, php, apacheはインストールされているLinux環境を前提にしています。
まずは、omeka用のデータベースをmysqlで作成します。
$ mysql -u root -p
（ここでrootのパスワードが未設定ならそのままEnter。）
omkyangというデータベースを作ってみます。
mysql> create database omkyang default character set utf8 collate utf8_unicode_ci;
データベースができたかどうか確認してみます。
mysql> show create database omkyang;
データベースがWebから書き込めるようにしつつ、パスワードも設定しておきます。
mysql> grant all privileges on omkyang.* to ifomkut_user identified by 'データベースomkyangのユーザifomkut_user のパスワード'
次に、omeka-2.5.1.zipをWebからアクセスできるディレクトリで展開して、ディレクトリ名を適当に変更します。
$sudo mv omeka-2.5.1 omeka-yang
その後、omekaの設定ファイルdb.iniを編集します。
$ sudo vi db.ini
db.iniの内容は以下のようにしてみます。
[database]
host = "localhost"
username = "ifomkut_user"
password = "データベースomkyangのユーザifomkut_user のパスワード"
dbname = "omkyang"
prefix = "omeka_"
charset = "utf8"
;port = ""
次に、一部のディレクトリをWebから書き込みできるようにします。
$ sudo chown -R apache files
ここまで来たら、とりあえず、このOmekaのURLにWebブラウザでアクセスしてみます。
http://digital.culturalresources.jp/omeka-yang/
そうすると、インストール画面にリダイレクトされます。あとは、画面の指示に従って入力していけばOmekaの設定は完了です。
Omekaのインストールが完了したら、次はプラグインのインストールです。
上記のコマンドラインの続きで、プラグインのディレクトリに入ってから・・・
$ cd plugins/
$ sudo wget http://omeka.org/wordpress/wp-content/uploads/IIIF-Toolkit-with-Mirador-1.0.0.zip
$ sudo unzip IIIF-Toolkit-with-Mirador-1.0.0.zip
こんな感じでダウンロードしたファイルを展開して・・・
以下のURLにブラウザでアクセスすると（あるいは管理者画面の上部メニューの「plugins」をクリックすると）
http://digital.culturalresources.jp/omeka-yang/admin/plugins
IIIF Toolkit with Mirador の項目が表示されてInstallボタンも現れますので、それをクリックします。
同様にして、地図年表上にアイテムをマッピングするために、NeatlineとNeatline Widget群をダウンロードしてそれぞれunzipしてからpluginsページでインストールしてしまいましょう。
$ sudo wget http://omeka.org/wordpress/wp-content/uploads/Neatline-2.5.1.zip
$ sudo wget http://omeka.org/wordpress/wp-content/uploads/Neatline-Widget-Waypoints-2.0.2.zip
$ sudo wget http://omeka.org/wordpress/wp-content/uploads/Neatline-Widget-SIMILE-Timeline-2.0.4.zip
$ sudo wget http://omeka.org/wordpress/wp-content/uploads/Neatline-Widget-Text-1.1.0.zip
なお、Neatlineを設定する際に、Google Maps API について聞かれますが、これは無視しても大丈夫です。NeatlineではOpen Street Mapを使うことができますので。
あとは、同様に、設定をしてしまえば使えるようになります。
詳しくは、以下のブログ記事などもご覧ください。